El Doctorado en Historia se vincula por medio de la colaboración de su NAB con instituciones tanto a nivel nacional como en el plano internacional. También los estudiantes realizan acciones de movilidad académica que vienen a fortalecer los convenios institucionales ya establecidos y construir nuevos vínculos. A continuación se enlistan algunas de las instuciones con las que se ha establecido vinculación.

• Universidad de Zacatecas

• Escuela Nacional de Conservación Restauración y Museografía (ENCRyM)

• El Colegio de Jalisco

• Universidad de Sevilla

• Universidad de la Habana

• El Colegio de Jalisco

• Universidad Michoacana

• El Colegio de Michoacán

• Universidad Complutense de Madrid

• CIESAS (Guadalajara)

• UdG (Lagos),

• Universidad Nacional Autónoma de México (UNAN)

• Centro de Investigación y Docencia Económicas, A.C. (CIDE)

• Colegio de México

• Universitat Jaume I

• Universidad Estatal de Campinas (Brasil)

• El Colegio de Michoacán

• Universidad Autónoma Metropolitana

• El Colegio de San Luis

• Centro de Investigaciones Multidisciplinares de Chiapas y la Frontera Sur (CIHMECH)

• Universidad Nacional Autónoma de México

• Centro de Investigaciones y Estudios Superiores en Antropología Social

• Universidad Iberoamericana

• Escuela Nacional de Antropología e Historia

• Universidad Federal de Integración Latinoamericana (Brasil)

• Universidad de Ciencias y Artes de Chiapas

• Escuela de Conservación y Restauración de Occidente (ECRO)

• Universidad Autónoma de Tlaxcala

• Unidad Pedagógica Nacional, unidad 162 Zamora

• Instituto Tecnológico y de Estudios Superiores de Occidente.

• EUDE Bussines School

• Universidad de Oviedo

• Universidad de Alcalá de Henares

• Instituto Universitario de Investigación en Estudios Latinoamericanos (IELAT).

• El Municipio de El Arenal